学校现有全日制在校生11644人，其中本、专科生7264人，硕士研究生3594人，博士研究生786人，台港澳学生508人，留学生537人。另有继续教育学生2467人，远程教育学生18155人，目前全校各类在校生达32266人。
学校致力于构建面向未来以高层次教育为主的人才培养体系，目前设有中医学、中药学、中药制药、药学、针灸推拿学、康复治疗学、公共事业管理（卫生事业）、药事管理、信息管理与信息系统、护理学、英语（医学、中医药国际传播）、法学（医药卫生）12个本科专业。
学校是全国高等中医药院校中首批建立博士学科点和博士后科研流动站的单位之一，设有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站。中医学、中药学、中西医结合均具有一级学科博士学位授权，囊括42个二级学科博士学位授予点，并有45个硕士学位授予点。5个专业学位类别，下设14个领域，包括9个博士学位授权点，14个硕士学位授权点。学校现有一级学科国家重点学科2个，涵盖二级学科国家重点学科15个；国家中医药管理局重点学科48个；一级学科北京市重点学科2个，二级学科北京市重点学科8个。重点学科建设在全国中医药院校中保持领先地位。
学校现有省部级以上科研基地48个，其中国家级国际科技合作基地2个；教育部重点实验室3个；教育部工程研究中心2个；高等学校学科创新引智基地2个；国家中医药管理局三级实验室14个；国家中医药管理局重点研究室11个；北京市重点实验室6个；北京市教委工程研究中心1个；北京市国际科技合作基地6个；北京中医药文化研究基地1个。
学校现有东直门医院（第一临床医学院）、东方医院（第二临床医学院）、第三附属医院（第三临床医学院）、枣庄医院（第四临床医学院）、深圳医院（第五临床医学院）、房山医院(第六临床医学院)、孙思邈医院（第七临床医学院）、厦门医院（第八临床医学院）8所附属医院。另有广安门医院、西苑医院、望京医院、中日友好医院、北京中医医院等24个临床教学基地，承担着全校学生的临床教学、见习、实习工作。学校现有国家临床重点专科15个，国家中医药管理局重点专科35个。建设有国医大师传承工作室5个，全国中医学术流派和全国名老中医药专家传承工作室42个，北京中医药“薪火传承3+3工程”名医传承工作站37个。
自建校之初，学校率先接收外国留学生，到目前已为94个国家和地区培养了2万余名中医药专门人才，并先后与30个国家和地区的118所知名大学和研究机构建立合作关系。先后开设我国首个全英文授课西医生学习中医博士、硕士学位项目，首个全英文授课中医学士学位项目。2016年，与西班牙巴塞罗那大学开展合作，推动中医硕士学位首次进入欧盟主流医学教育体系。
学校于1991年在德国建立了北京中医药大学魁茨汀医院，开创了中国大学在海外办医院的先例。2012年，与日本学校法人兵库医科大学合作建立了中医药孔子学院。学校的国际化发展不断探索创新，开创了集医疗、教育、研究、文化传播为一体的海外中医中心模式，先后建立北京中医药大学澳大利亚中医中心、俄罗斯中医中心、美国中医中心，把中医药打造成中外人文交流、民心相通的亮丽名片。
面对高等教育和中医药事业发展的新形势，学校正加快高质量发展步伐，主动适应国家战略和社会发展的需求，坚定不移地走教育传承与创新和学科内涵发展之路，为建设“有特色、高水平、国际知名的研究型大学”而努力奋斗。
