厦门医学高等专科学校是经国家教育部批准成立的一所公办医学类普通高等专科学校。学校创建于1953年9月，由当时闽南唯一的公立护士学校-厦门护士职业学校、厦门医士学校和厦门第二医院护士学校合并而成，“文革”一度停办，1972年复办。办学近60年来，经过几代人艰苦奋斗、自强不息、求真务实、开拓创新，初步建成了一所规模适度、结构合理、特色鲜明的医学高等专科学校。建校以来，已培养二万多名合格的卫生技术人才，为厦门及海西的医疗、卫生、教育事业做出了积极贡献。
最初的校址在厦禾路336号，即现在的开元区医院所在地，一年后迁至厦禾路350号，1956年迁石泉路7 号，即现在的军区招待所所在地，1958年因创办厦门医学院，厦门卫校石泉山校舍划归医学院使用，厦门医学中等教育改由各医院举办。1963年，鼓浪屿医院卫生学校迁到石泉路7号原厦门卫生学校旧址，恢复厦门卫生学校旧称。“文革”期间，学校遭受严重冲击，直至停办。1972年秋季学校复办时，校名改称为福建省厦门卫生学校，校址就确定在了白鹿路24号，从此，这块土地就成为厦门培养中等卫生技术人才的摇篮。从学校创办至今，先后开设过护士、助产士、西医士、中医士、口腔医士、卫生财会与统计等专业，1979年招收过医学大专班，1985年在华厦基金会的赞助下开始筹建口腔医院，作为学校的附属医院，90年医院正式建成。在1990年以后，学校获得比较大的进步，上了两个台阶，第一个台阶是在90年到92年，这个时期学校抓好各项基础设施的建设，校容校貌更新，师生精神空前振奋起来，上第二个台阶是在招生年至今，这个时期学校迅速发展，规模扩大，管理水平、教学质量普遍得到提高。这几十年来，学校毕业学生一万多名，他们遍布全省各地，为人民健康事业做出了应有的贡献，涌现出如全国卫生先进工作者林成水、全国模范护士陈珍霞等一大批优秀卫生技术人才。2001年，经市政府批准在学校成立厦门医学高等专科学校筹建处，负责组建厦门医高专工作,2002年厦门医高专通过省高校设置评审委员会考察，经省长常务会、省委常委会议决定，报教育部验收，医高专已于2003年秋季开始招生。
